PICRUSt2を使用してみる

PICRUSt1の後継、PICRUSt2を最近使用し始めた。微生物叢(16Sの場合、細菌叢)内に存在するgene familiesやパスウェイを16S amplicon sequencing dataから予測するツールである。GG13_5に対してpickされたOTUだけでなくAmplicon Sequence Variantsも入力として用いることが出来る(1もGG13_5に対してClosed Reference OTU …