結合自由エネルギー変化の計算をする:AmberToolsとMM-PBSAを使った方法 : Ag++
以前の記事で、小さな化学小分子のパラメータを自作してAMBER, Gromacs上でMD simulationをさせる方法を行いました。 これは別に生物に限った話ではなく、化学の超分子の分野でも自己会合する分子の知見を得るために使われることもあるみたいです。って某AIDA研の同期が言っ