ほくそ笑む
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RDP Classifier の原理
1. はじめに RDP Classifier は、RDP(Ribosomal Database Project) により開発された、16S rRNA 配列から菌種を判別するためのツールです。RDP Classifier は、BLAST に比べて数百倍の速度で菌の判別(簡易同定)を行うことが可能です。また、この論文によると、RDP Classifier は misclassify はありますが、BLAST と同程度…