macでインフォマティクス
id:kazumaxneo
RNA seq 其の2 マッピングから統計処理まで
基本的な流れは以下のリンクが参考になる。 github.com 今回はSRAに登録されているクラミドモナスのtime courseデータを使う。クラミドモナスはEnsemblにドラフトだがfastaもgtfも登録されているので非モデル生物より解析は楽になる。 クラミドモナスゲノムのダウンロードは Chlamydomonas reinhardtii - Ensembl Genomes …