CGView Comparison Toolによるバクテリアのゲノム比較6 -次世代リードのアライメント

次はCCTを使って次世代データをリファレンスに当てて、リードの張り付きをビジュアル化するチュートリアルを見ていく(公式ページチュートリアル6)。 CCTのインストールは以下で説明しています。 今までと流れが微妙に異なっているので注意する。 francisellaプロジェクトをビルドする。 cgview_comparison_tool.pl -p fr…