PanPhlAnによるメタゲノムのプロファイリング

PanPhlAnはメタゲノムをstrainレベルで解析するツール。調べるのは遺伝子の有り/無しで、データベースのゲノムと比較することでメタゲムシーケンスしたバクテリアの特定の種に、実際にはどれくらいの多様性があるか(どれくらいのstrainが混じっているか)を調べることが可能となっている(本手法でプロファイルの指標にな…