macでインフォマティクス
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Reference-assisted assembly4 AlignGraph
AlignGraphは、よく似たゲノム配列を使いcontigを伸ばしたり繋いでくれるツール。よく似たゲノム配列が存在するとき、アセンブリして作ったcontigやscaffoldsをさらに伸ばすために使われたりする。 インストール 依存 Bowtie2 BLAT PBLAT (http://icebert.github.io/pblat/ ) NUCMER bowtie2、BLAT、NUCMERはbrewで導入で…