macでインフォマティクス
id:kazumaxneo
メタゲノムデータの高速なtaxonomy assignmentを行う kraken
2018 10/6 タイトル修正 2018 11/17 簡単なテスト追加 2019 4/12 dockerリンク追加 2019 10/15リンク追加 krakenは2014年に発表されたメタゲノムデータの分類手法。fastqまたはfastaの入力からk-merの配列に分解し、構築したデータベースにアライメントを行う。BLASTと同等の精度を保ちながら、megablastより最大909倍高速…