プラスミド配列を予測する cBar

cBarは(論文発表当時では)大規模なトレーニングデータを用いて学習されたメタゲノムなどのデータ(FASTA)中の プラスミドゲノムを区別する方法論。5量体頻度(pentamer frequencies)を元に判定を行う。入力はFASTAは配列。 インストール macOSXではビルドでエラーを吐いたのでcent OSに導入。 cBar公式HP (ダウンロー…