BBtoolsを使い各クロモソームのカバレッジを計算する

2/26 コマンド修正 様々な方法があるが、正確に出すのは意外に難しい(例えばsamtools mpileupは0カバレッジをカウントしない)。ここではBBtoolsのpileup.shを使い各クロモソームのカバレッジを個別に計算するコマンドを紹介する。 インストール #condamamba install -c bioconda bbmap -y#homebrewbrew install BBtools …