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微生物は数と多様性の両方で生命の樹木を支配しており、その自然分類を困難かつ重要なものにしている。動物では、種は一般に交配可能な生物群と定義されるが（biological species concept）、この定義は無性生物の集合体に直接適用することはできない。結果として、微生物分類学は、生物に関する遺伝子型、表現型および化…