SRA Toolkitのfastq-dumpを並列実行して高速化する parallel-fastq-dump
NCBIのfastq-dumpはリソース（ネットワーク、IO、CPU）が速くても、時には非常に遅くなることがある（Githubのprotipを参照）。 fastq-dumpにはsraファイルの特定の範囲を照会するオプション（-Nと-X）があるため、このツールparallel-fastq-dumpは作業を要求されたスレッド数に分割し、複数のfastq-dumpを並列実行して高…
