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バクテリアシーケンシングデータの種間、種内汚染を検出する ConFindr
ConFindrはバクテリア種間およびバクテリア種内のNGSデータの汚染を検出できるパイプライン。かなり良い感受性で実行でき、 2つのサンプルを混ぜ合わせ、それらの間にわずか500のSNP(> 99.9%同一!)がある場合でも同定することができる。これにより、NGSサンプルの厳格な品質管理が可能になる。ConFindrはrMLST遺伝子を…