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シーケンスの類似性を検出するためのプロファイル隠れマルコフモデル（HMM）の使用は広く普及している。それらの人気は、いくつかの関連およびアラインされた配列を使用してプロファイルHMMを構築できるという事実に由来し、それを使用して大きなシーケンスデータベースを検索し、distantly relatedな配列を含む関連配列を…