macでインフォマティクス
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All Versus Allの配列比較(sequence comparison)を行うEMBOSSの needleall
2020 10/29 vsearchのコマンド追記 needleall は入力された一連の配列を読み込み、それらをすべて 1 つ以上の配列と比較し、最適なグローバル配列のアラインメントをファイルに書き込む。Needleman-Wunschアライメントアルゴリズムを使用して、全長に沿った2つの配列の最適アライメント(ギャップを含む)を見つける。この…