Trinityのalign_and_estimate_abundance.plスクリプト
2021 12/25追記 Trinityに付属するスクリプトalign_and_estimate_abundance.plは、最初にBowtieアライナーを使用してRNA-SeqリードをTrinity転写物にアラインし、その後、RSEMを使ってアバンダンス推定を実行する。 RSEMは、isoformなどの一意にリードをマッピングして定量することが難しい配列に対して、isoform 内でユニ…
