macでインフォマティクス
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nf-coreのDeepVariantパイプライン
nf-core/deepvariantより 2017年12月にGoogleブレインチームがDeepLearningをベースにしたVariant Caller, DeepVariantをリリースした。DeepVariantはまずBAMファイルに基づいて画像を構築し、次にDeepLearningの画像認識アプローチを使用してバリアントを取得し、最終的には予測の出力を標準的なVCF形式に変換する。 Next…