SOSUIとTMHMMを使って膜タンパク質の膜貫通領域を予測する

<a href="http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/" target="_blank" rel="noopener">SOSUI</a>と<a href="http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/" target="_blank" rel="noopener">TMHMM</a>は、アミノ酸配列を元に、膜タンパク質であるかどうかの判別や、膜貫通領域を予測するツールです。<a href="http://bp.nuap.nagoya-u.ac.jp/sosui/" target="_blank" rel="noopener">SOSUI</a>は配列相同性などを参照しない物理化学的な手法により、99%という高精度で膜タンパク質を判別することができます。また、<a href="http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/" target="_blank" rel="noopener">TMHMM</a> (Transmembrane Hidden Markov Model) は、隠れマルコフモデルを使った膜貫…