PET検査に用いるFDGからは放射線（γ線）が放出されますので、検査を受けることで、わずかではありますが、被ばくします。しかしその量は、地球上で普通に生活していて1年間に受ける放射線の量とほぼ同じと考えられ、PET検査による被ばくは、人体にほとんど影響がないと言われています。