Raspberry Pi 3向けに、SDカード以外のブート方法を提供するための機能が追加されています。現在はベータ版の扱いなので、不具合があるかもしれませんが、試す手順なども掲載されています。 現在はUSBブート、PXEブートの2種類が紹介されています。 https://www.raspberrypi.org/blog/pi-3-booting-part-i-usb-mass-…