リポジトリのファイルを削除するのはどうするの?gitのファイル操作にまだ慣れていない。

最近、自分で作ったスクリプトとかそういうものはローカルに保存ではなくgitで管理するようにしています。 リポジトリをforkして、その中のファイルを削除して、新たにcommitしようとしたんだけどその中の削除がよくわからなかったので調べました。 rmで実行するのか gitの操作はGUIでやっている人もいるかもしれないです…