ひみつ基地ミュージアムは、太平洋戦争末期、九州山地に囲まれた海のない盆地に建てられた「人吉海軍航空基地」の跡地に作られました。どうして海のない土地に海軍基地が建てられたのか、どのような活動をしていたのか、今明らかになります。