[アップデート]Systems Manager 高速セットアップでは、組織内の全アカウントのEC2インスタンスに対してSSM機能を有効にしてくれるDHMCがサポートされました | DevelopersIO
AWS Organizationsを利用、かつ、SSMを利用する環境であれば、ぜひ利用を検討しましょう。