今後のGATK解析で使用するWGSデータの収集 -GATK解説シリーズ-part 2
sra-toolkit, fasterq-dump, sra-toolkit 導入難易度★☆☆☆☆ 使用難易度★★☆☆☆ 今回は何をする？ 今後のGATK解析で使用するマラリア原虫のWGSデータを収集します。せっかくなので、以前のprefetchとは違うfasterq-dumpを使ったダウンロードの方法を紹介します。今後は、今回収集したデータを使って、GWASで使用する変異データ…
