GATK HaplotypeCallerの使い方 前編 -GATK解説シリーズ-part 5

GATK HaplotypeCaller 使用難易度★★★☆☆ 本記事は、GATK解説シリーズのPart 5の前編です。 eupatho-bioinfomatics.hatenablog.com 今回は何をする? GATK HaplotypeCallerを使って、前回の記事で得たBAM形式ファイルから、変異情報の記載されたVCFファイルを出力します。 前編では、GATK HaplotypeCallerについて勉強しまし…