バイオインフォマティクスでゲノムワイド関連解析（GWAS)

GATK BaseRecalibrator, ApplyBQSR 使用難易度★☆☆☆☆ 本記事は、GATK解説シリーズのPart 9です。 GATK解説シリーズのリンクまとめは↓こちら eupatho-bioinfomatics.hatenablog.com 今回は何をする？ 前回のGATK VariantFilterationで出力された、merged_snps/indels_filtered.vcfを基にBQSRを行います。 これまであまり理解…