謎の生命体ゾヴァラスは、黒いメテオを持つメテオカイジュウ・ヴァルジェネスと、オメガの過去に深く関わっていた。 怪獣を操る強力な能力を持つゾヴァラスからヴァルジェネスを救う為、サユキとアユムに頼る決心を固めるソラトとコウセイ。 オメガ抹殺と地球支配を目論むゾヴァラスを打倒する為、4人はNDFも巻き込んだ決…