元地球防衛軍の技術者・大河原は、独自に開発した巨大ブルドーザー兵器ヘクトールを用いてヒマラヤ山脈の地中を掘り進み、怪獣退治に乗り出した。しかし、ヘクトールの中に液体怪獣が入り込み機械怪獣ヘクトールへと変貌、突如暴走を始める。