侵略星人ジャダンが、無数のUFOを送りこんできた。宇宙防衛戦闘隊が大気圏外で迎え撃つが、地球への侵入を許してしまう。科学警備隊がUFOを撃墜したが、ジャダンは人間に乗り移り、極東ゾーン基地へと潜入しシステムを破壊、わらに怪獣ジャゴンへと姿を変える。