バランガスが突如、市街地に出現。あらゆる兵器がまったく通用しない強力怪獣に苦戦するUMAを救ったのは、姿を消していたスタンレーだった。友好的な態度でUMA基地を訪れたスタンレーを疑うジャックは、再度姿を消したバランガスを迎撃するため出動。その隙にスタンレーは……。