怪獣島が日本に迫っていた。激突すれば島の岩石が爆発し甚大な被害が予想される。激突まであとわずか。ＵＤＦ本部はコスモディーバで島を爆撃することを決定する。しかし島にはカイトとミズキが残されていた。