大きな穴を覗き込んだ人々がみな錯乱状態になってしまう事象が発生。その調査のさなか、テルアキ、アンリ、ヤスノブまでもがその餌食になってしまう。アースガロンに単身搭乗したエミは、AI対話システム「EGOISS（イーゴイス）」とともに、怪獣モグージョンとの戦いに挑むことになる。