macでインフォマティクス
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SuperTranscripts 其の2
Githubで紹介されている、Supertransctiptsを非モデル生物のRNA seq解析に適用する場合の流れを確認する。以下のようなフローをとる。 de novoアセンブリして得たcontigにマッピングして定量し、定量結果からクラスタリングする。そのクラスタリング情報を使ってSupertransctiptsを構築する。最後に、Supertransctiptsを使…