macでインフォマティクス
id:kazumaxneo
samファイルのクリッピングされたアラインメントを除く samclip
Githubより ほとんどのショートリードアライナーは、参照ゲノムに対するリードのローカルアライメントを行う。例として、bwa mem、minimap2、bowtie2などがある(--end-to-endモードの場合を除く)。つまり、リードの両端がベストアライメントに含まれていない可能性がある。これは次のような場合に起こる。 アダプター配…