bowtie2を使ってアセンブルした配列を評価する
bowtie2はマッピング結果の要約統計を標準エラー出力として報告する。Trinityのwikiでは、これを利用してde novo transcriptome assemblyを評価する流れがまとめられている。 RNA Seq Read Representation by Trinity Assembly · trinityrnaseq/trinityrnaseq Wiki · GitHub 実行方法 １、indexing bowtie2-build --thread…
