Trinityのabundance_estimates_to_matrix.plスクリプトで発現行列を出力、filter_low_expr_transcripts.plスクリプトで低発現転写産物をフィルタリングする

Trinityに付属するスクリプトabundance_estimates_to_matrix.plは、align_and_estimate_abundance.plの出力を入力として、複数サンプルを(正規化しつつ)統合した発現行列ファイルを生成するスクリプト。Trinityのマニュアルに習い、使い方を確認しておく。 インストール ubuntu18.04LTSでcondaの仮想環境を作ってテスト…