発現変動遺伝子を同定するTrinityのrun_DE_analysis.plスクリプト
Trinityに付属するスクリプトrun_DE_analysis.plを使うと、BioconductorのRパッケージを使って発現変動遺伝子群を同定して分析することができる。Trinityのabundance_estimates_to_matrix.plなどを使って得た発現行列ファイルを使う。 手順はTrinityのマニュアルに従っている。 インストール ubuntu18.04でtrinityの仮想環…
