無縁塚の花騒動より半年以上が過ぎ、日も短くなって確かな冬の足音を感じる頃、アリスは『自律する人形』の話を耳にする。無縁塚へと赴き、そこで念願の自律人形、メディスンとの対面を果たすも、人形遣いと人形との間には大きな軋轢が。　不器用ながらも距離を縮めようとするアリスと、次第に心を開いていくメディとの…