MDシミュレーションのチュートリアル記事を書いてみました。 今回題材として選んだタンパク質はPDB: 1LKEです。 この構造のポイントは以下の3つです。 リガンドとしてDigoxigeninが結合している TYR-117とGLY-123の間に構造データが存在しないミッ...