Palmsonntagmorgen

chromapは高速・高精度にリードをゲノムにマップするツールです*1。 既存ツールのbwaやbowtie2よりも遥かに高速だとのことなので、ここではChIP-seqデータを用いて使用法及び速度・精度面を確かめてみたいと思います。 chromapについて chromap は minimap2*2の後継です。NGS解析では通常リードがどこにどのくらいマップさ…