chromapを試す(その2)

高速にマッピングできるchromap*1 の続きです。今回はHi-Cデータに対してマッピングし、BWAと比較します。 前回の記事はこちら rnakato.hatenablog.jp Hi-Cファイルの取得 今回はHaarhuisらのCell論文*2 のデータを使いました。ヒトHap1細胞でのHi-Cデータです。 fastq-dump --split-files --gzip SRR5266584 BWAでマッピ…