Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) は、予め用意した遺伝子セットが異なる条件下でどう振舞うかを調べる手法です。これを利用し発現プロファイルを解釈することができます。詳しいアルゴリズムは、<a href="http://www.broadinstitute.org/gsea/doc/subramanian_tamayo_gsea_pnas.pdf" target="_blank" rel="noopener">Gene Set Enrichment Analysis PNAS paper (pdf)</a>を参照してください。<a href="http://www.broadinstitute.org/gsea/" target="_blank" rel="noopener">GSEA software</a>は<a href="http://www.broadinstitute.org/" target="_blank" rel="noopener">Broad Institute</a>によって実装された…