自由学園中等部高等部では、学園を一つの社会として生徒がつくる『自治』、学習を社会課題解決に導く『共生学』、夢中を見つける『探求学習』といった学年と教科の枠を超えた学び、ダイバーシティを育む寮での学び、食事作りや野菜の育成と植林や育林などの実学など、実験・実践・体験を重視した深い学びを展開しています。