アプリケーション層の通信プロトコルは、アプリケーション間でどんな手順でやりとりするかを定めたものだ。従ってアプリケーションごとにプロトコルを規定している。例えばファイルを転送する際にはFTPを使い、メールのやりとりにはSMTP、POPを使うといった具合だ。